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ai sensi dell'art.36 CCNL 14.09.2000 comma 2 l'indennità di maneggio valori compete per le sole giornate in cui il dipendente è effettivamente adibito ai servizi che comportino maneggio di valoridi cassa.
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durante le ferie, l'economo agente contabile perde l'indennità??

Così dovrebbe essere.
Comunque è necessario un apposito regolamento che disciplini il funzionamento del servizio e la corresponsione delle (eventuali) indennità.
N.B. l'indennità di maneggio valori è soggetta a contrattazione e deve essere finanziata dal Fondo per la produttività ed il miglioramento dei servizi.